Negli anni 2000 il laboratorio Aragona acquista diverse attrezzature per rendere più efficiente il lavoro:

• Anno 2000 acquisto analizzatore automatico per Chimica Clinica BT Targa 2000 (300 test/ora) e Gruppo di Continuità elettrica da 3000 VA.
• Nel 2001 acquisto lettore automatico di strips per immunoenzimatica in modo tale da ampliare il pannello degli esami non eseguibili sul Mini VIDAS (anticorpi della tiroide, insulina, HSV, paratormone, calcitonina).
• Dal dicembre del 2001 il laboratorio si dota di Sistema Informatico Gestionale in rete.

Il 22/1/2002 è la data in cui viene rilasciata una nuova autorizzazione, la n° 000893, dal Direttore Generale della AUSL n° 5 di Messina per l’avvenuta ridistribuzione interna dei locali del Laboratorio, classificato come Generale di base, per rendere più comode le aree destinate sia all’utenza (sala d’attesa climatizzata dotata di un numero di posti a sedere congrui rispetto ai picchi d’accesso, sala prelievi climatizzata e garante della privacy, bagno e telefono dedicati all’utenza) sia al Laboratorio.